- Rektörlük Birimleri
- Uygulama ve Araştırma Hastanesi Başhekimliği
Enstitüler
- Atatürk İlkeleri ve İnkılap Tarihi Enstitüsü
- Deniz Bilimleri ve Teknolojisi Enstitüsü
- Din Bilimleri Araştırma Enstitüsü
- Eğitim Bilimleri Enstitüsü
- Fen Bilimleri Enstitüsü
- Güzel Sanatlar Enstitüsü
- İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü
- Onkoloji Enstitüsü
- Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Sosyal Bilimler Enstitüsü
Fakülteler
- Buca Eğitim Fakültesi
- Denizcilik Fakültesi
- Edebiyat Fakültesi
- Fen Fakültesi
- Güzel Sanatlar Fakültesi
- Hemşirelik Fakültesi
- Hukuk Fakültesi
- İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi
- İlahiyat Fakültesi
- İşletme Fakültesi
- Mimarlık Fakültesi
- Mühendislik Fakültesi
- Reha Midilli Foça Turizm Fakültesi
- Sağlık Bilimleri Fakültesi
- Spor Bilimleri Fakültesi
- Tıp Fakültesi
- Veteriner Fakültesi
Yüksekokullar
- Devlet Konservatuvarı
- Fizik Tedavi ve Rehabilitasyon Yüksekokulu
- Seferihisar Fevziye Hepkon Uygulamalı Bilimler Yüksekokulu
- Yabancı Diller Yüksekokulu
Meslek Yüksekokullar
- Adalet Meslek Yüksekokulu
- Bergama Meslek Yüksekokulu
- Efes Meslek Yüksekokulu
- İzmir Meslek Yüksekokulu
- Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu
- Torbalı Meslek Yüksekokulu
Koordinatörlükler ve Diğer Birimler
- ÖYP Koordinatörlüğü
- 100/2000 Yükseköğretim Kurulu Doktora Bursu Koordinatörlüğü
- Merkez Kütüphane
- Kariyer Planlama ve Mezunlarla İlişkiler Koordinatörlüğü
- Döner Sermaye İşletme Müdürlüğü